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DNFB和Edman是两种不同的蛋白质N末端序列分析方法，其原理不相同但是非常类似，都是利用化合物与蛋白质的末端氨基酸进行反应生成氨基酸-化合物复合体，再对该产物进行鉴定从而实现N末端氨基酸序列的分析，只是两者利用的化合物以及反应的原理不同。下面对两种方法的原理进行简单介绍。
DNFB即2, 4-二硝基氟苯，在弱碱性环境（pH=8.0~9.0）下可以与蛋白质N末端的α氨基酸结合生成稳定的2, 4-二硝基苯氨基酸（DNP-氨基酸），DNP-氨基酸易溶于有机溶剂如**和乙酸乙酯等，用有机溶剂提取DNP-氨基酸，再通过纸层析法或色谱法对其进行鉴定。
Edman降解法通过循环3个化学反应实现N末端氨基酸的序列测定。其基本原理是利用异硫氰酸苯酯（PITC）特异性识别并连接在待测蛋白质的N端氨基酸上形成PITC-蛋白复合物；在酸处理条件下，PITC连接的N端氨基酸被切割，形成不稳定的PITC-氨基酸复合物；被萃取的PITC-氨基酸复合物在酸性条件下转化为稳定的苯基乙内酰硫脲（PTH）衍生物；zuì后利用高效液相色谱HPLC鉴定氨基酸种类。每次Edman 反应只断裂一个氨基酸，将少了一个氨基酸的多肽链进行回收并重复以上操作，直到zuì后鉴定出N末端的氨基酸排列顺序。
百泰派克公司采用岛津公司Edman测序系统，为广大科研工作者和科研客户提供基于Edman的N端测序服务技术包裹，可对纯化后蛋白产物、抗体以及蛋白疫苗的N末端氨基酸序列进行准确测定。此外，百泰派克生物科技也建立了以先jìn的LC-MS/MS技术进行N-端测序的平台，可以测出封闭和修饰的蛋白质末端，与Edman降解法形成互补，保证N端测序服务的顺利进行。
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