定量蛋白质组学就是对系统中的不同蛋白质进行含量的j_ī_n_g|q_u_è鉴定，目前主要是根据基于质谱的技术对蛋白质进行含量鉴定。常用的蛋白质定量技术如非标记定量策略（Label Free）和标记定量策略（iTRAQ、TMT、SILAC等），其基本原理都是将带标记的或未标记的蛋白质酶切消化成小分子肽段，再对小分子肽段进行HPLC-MS/MS分析，通过对质谱数据进行生物信息学分析从而实现蛋白质的定量鉴定。
由此可见，基于质谱的蛋白质定量分析主要是基于质谱图所反映的肽段离子的理化性质来实现的。4D定量蛋白质组学技术即利用4D质谱分析技术对蛋白进行定量分析，相比传统的3D定量蛋白质技术，4D质谱分析方法通过新增的离子淌度（mobility）这一维度可根据肽段离子的形状和碰撞面积（CCS）对其进行分析，能够检测质荷比（m/z）差值非常接近的肽段，对低丰度的肽段离子也能发挥很好的检测作用，在检测灵敏度以及准确度方面都有很大的提升。
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