检测技术服务:百泰派克生物科技BTP客户案例：通过蛋白质谱鉴定分析多粘类芽孢杆菌果胶酸裂合酶活性zuì高的组分--检测技术服务详情
关键词：百泰派克生物科技,质谱鉴定蛋白质,蛋白鉴定质谱,百泰派克生物科技,生物药物表征,生物药物多组学,优质服务商,蛋白质组学,代谢组学,tmt,抗体测序,itraq,蛋白质谱鉴定
期刊：Molecules；影响因子: 5.1098
原文链接：DOI: 10.3390/molecules23112774
研究对象：苎麻纤维、多粘类芽孢杆菌
研究目的：多糖裂合酶家族10（PL10）的酶在苎麻脱胶中的应用研究
研究手段：蛋白质谱鉴定等
研究内容及结论：苎麻纤维表面覆盖有一种胶样物质，限制了它在纺织工业中的应用。有研究表明，脱胶过程可以通过果胶酸裂合酶的酶催化来实现，与碱性脱胶相比酶法脱胶具有效率高、条件温和、对环境友好等优点。还没有研究PL10的果胶酸裂合酶在苎麻脱胶中的应用。该研究从多粘类芽孢杆菌KF-1分泌的酶提取物中筛选出一种新的PL10果胶酸裂合酶，并通过LC-MS/MS进行了蛋白质谱鉴定。基因克隆自KF-1的基因组DNA，并在大肠杆菌中表达。重组酶PpPel10a的预测Mr值为45.2 kDa，pI值为9.41。以聚半乳糖醛酸（PGA）为底物，确定了PpPel10a的zuì佳反应条件为50℃，pH 9.0。以PGA为底物的PpPel10a的Km、vmax和kcat值分别为0.12 g/L，289 μmol/min/mg和202.3 s-1。重组PpPel10a可降解柑橘果胶，产生不饱和单半乳糖醛酸和寡半乳糖醛酸。PpPel10a降低了PGA的粘度，且观察到单PpPel10a或PpPel10a与碱结合处理后，苎麻纤
维的重量分别减轻了22.5%和26.3%。表明PpPel10有应用于植物纤维加工的潜力。
通过nanoLC-MS/MS蛋白质谱鉴定分析多粘类芽孢杆菌果胶酸裂合酶活性zuì高的组分，该服务由北京百泰派克生物科技提供。共鉴定到28个蛋白质，包括4个果胶酸裂合酶，1个果胶酯酶和23个非果胶降解酶。10个多肽片段搜库结果表明他们都属于四个果胶酸裂合酶家族，且分别属于PL家族1、3、9和10，其中属于PL10家族的多肽片段在LC-MS/MS分析中显示出zuì高强度。
参考文献：Zhao Y, Yuan Y, Zhang X, et al. Screening of a novel polysaccharide lyase family 10 pectate lyase from Paenibacillus polymyxa KF-1: cloning, expression and characterization[J]. Molecules, 2018, 23(11): 2774.
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